Emmanuel Pisani est français et vit au Caire. Depuis juin 2020, il est directeur de l’Idéo.
Il a soutenu une thèse d’État en philosophie et une thèse canonique en théologie sous la direction de Geneviève Gobillot et de Michel Younès sur la pensée d’Abū Ḥāmid al-Ġazālī sur les hétérodoxes et les non musulmans.